Разве, если в установщике плагина есть варианты и 32 и 64, они ставятся куда то в разные места?
Конечно , они никогда не падают в папку вст3 ) папка вст3 только для вст3 )
обычно дефолтный 32 бита путь в program files (x86)/vstplugins , а для 64 бита vst2 program files/vstplugins
vst3 program...