Мне помогло такое действие (правда спустя 2 года после начала этого топика и в Win 10 и на версии Reaper 6.73), но я пришел сюда за решением и не смог найти его, теперь предложу свое, может кому-нибудь поможет):
Вот эту галочку нужно снять, что позволит работать со звуком в Reaper и при этом...