Scarlatino,
1) по-моему это не лечится, хотя могу ошибаться
2) попробуй отключить Cross Hair Cursor. Вообще меняется ли поведение, если рисовать не с зажатым Альтом, а с помощью Draw Tool?
PS+, может быть какое-то окно на фоне открыто? Например, сэмпл эдитор не закрыл и он прячется за главным...